安诺优达合作伙伴阿里云提供免费基因计算服务,60秒即可完成病毒基因对比
2020.03.15

全球疫情肆虐,各大科技公司都在竭尽全力抗击疫情。


3月13日,安诺优达合作伙伴,全球领先的大数据服务供应商阿里云宣布,将向全球一线病毒研究机构免费开放基因计算服务,医疗科研机构、疾控中心等可在云上进行病毒基因比对,只需60秒即可完成包括新冠病毒在内的任意病毒基因对比工作,对进一步了解病毒变异提供有效依据。目前,安诺优达已借助阿里云的计算能力从某肿瘤样本数据中寻找病毒相关序列的数据,用于进行病毒活动与某肿瘤发生的相关性研究。


病毒经过数代传播,会产生变异,追踪掌握病毒变异情况成为科研人员的重中之重。宏基因组测序mNGS是目前较为有效的追踪方案,配合病毒库可精准确定病毒的代际关系,甚至找到病毒源发地。


但此前的mNGS数据分析较为耗时,以某新冠重症患者为例,系统需要对2200万个序列超过32亿个碱基一一和病毒库比对,检测出新冠病毒特征区域的完全匹配系列,通常这一过程需要30分钟或更久。


据了解,此次阿里云免费开放的基因计算服务AGS(Alibaba Genomics Service),采用容器技术和GPU,即开即用,可同时运行多个病毒基因比对服务,大大缩短了这一进程,60秒内即可获取高质量的基因比对报告,为患者提供更为准确的医疗方案。


安诺优达也希望通过阿里云提供的免费基因计算服务,能够联合疾控中心、高校、科研院所、医院及基因企业一起,为打赢这场疫情狙击战携手共进。

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