CN| EN

首页 > 新闻中心  > 行业动态

测序仪大起底,家底都给你!

安诺优达2017-04-01

导语:高通量测序技术又称为下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统测序(Sanger测序)一次革命性的改变,该技术可以对数百万个DNA分子进行同时测序。具有速度快、准确率高、成本低等特点。今天小编为您系统梳理了高通量测序技术平台发展史及各平台技术对比。


高通量测序技术


高通量测序技术又称为下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS)是相对于传统测序(Sanger测序)一次革命性的改变,该技术可以对数百万个DNA分子进行同时测序。具有速度快、准确率高、成本低等特点。


图1 高通量测序流程

探秘NGS测序平台发展史


高通量测序技术自2005年454公司推出第一台基于焦磷酸测序二代测序仪开始,到2017年Illumina推出NovaSeqTM系列,高通量测序技术经历了十几年的飞速发展。人类基因组测序成本已经从人类基因组计划的约30亿美元降到了1000美元左右。在技术发展过程中,NGS测序平台经历了一系列的收购和合并,最终形成主要三家测序平台,包括:Illumina的Solexa平台、Life Technologies的 Ion Torrent平台和华大基因的Complete Genomics平台。

表1 NGS测序平台发展史


解析NGS测序平台


Illumina平台

Illumina由于其技术成熟,平台之间高度互补性与交叉性,使得其在短读长测序上大占优势,是目前应用最广泛的NGS平台。目前其占据了测序仪市场约70%的市场份额。采用边合成边测序(SBS)技术原理,这套基于DNA簇(DNA cluster)、桥式PCR和可逆阻断等核心技术的系统具有高通量、低错误率、低成本、应用范围广等优点。


Illumina公司具有超强的研发能力,其产品覆盖了从低通量的Mini-Seq到超高通量的HiSeq X、 NovaSeq系列。相对于Ion Torrent平台的优势在于检测连续相同碱基时拥有较低的错误率。


主要平台:

MiniSeq

MiSeq 、 MiSeqDx、MiSeq FGx

HiSeq 2000、HiSeq 2500、HiSeq 3000、HiSeq 4000

NextSeq 500、NextSeq 550

HiSeq X Five、HiSeq X Ten

NovaSeqTM


Life Technologie平台

Life公司Ion Torrent测序平台采用的为半导体测序原理,在半导体芯片孔中的微球上固定DNA链,随后依次掺入ACGT。每加入一个碱基释放出来的H离子,反应池中的PH发生改变,位于池下的离子感受器就会感受到信号,把化学信号直接转化为数字信号,从而读出DNA序列。


Ion Torrent测序平台其在非碱基多聚体(non-homopolymer)的测序上正确率与其它NGS平台相差无几,而对于连续碱基的检测还不够完善,在检测同一碱基连续出现时的数量可能会有所误差。


Ion Torrent测序平台相对于其他平台,测序通量较小,平台数量也较少。


主要平台:Ion PGM;Ion Proton;Ion S5;Ion S5XL

Complete Genomics平台

Complete Genomics平台采用了高密度DNA纳米芯片技术,在芯片上嵌入DNA纳米球,然后用复合探针-锚定分子连接(cPAL)技术来读取碱基序列。


虽然这些技术非常准确,但是在敏感性与特异性之间依然不能达到完美的平衡,当一些错误的碱基变化出现时,真实的碱基变化可能被忽略。该类技术在应用上最大的限制可能就是其过短的读长。尽管所有的平台都能产生单末端和双末端的reads,但Complete Genomics单端最长只能达到100bp,使得其在基因组拼接和结构变异研究中的可操作性大大降低。


主要平台:BGISEQ-500;BGISEQ-50


表2  NGS测序平台对比


安诺优达作为中国基因组行业的知名企业,目前拥有 NextSeq 550AR、NextSeq 500、MiSeq、HiSeq 2500/4000及HiSeq X Ten等不同系列平台,可以对 DNA、RNA 等不同分子类型的样本进行测序分析,具备检测大批量样本的能力。


其中,NextSeq 550AR基因测序仪是安诺优达与美国Illumina公司合作开发的新一代桌面式高通量基因测序仪,近日成功通过国家食品药品监督管理总局(CFDA)认证。该测序仪也是目前全球临床基因测序仪的最先进机型。具有通量高、速度快、数据精准、性能稳定、操作简单等特点,可广泛应用于各级医疗机构、临检中心和科研院所,更好地服务于中国临床检测及科学研究。


参考文献:

[1] Sara Goodwin, John D. McPherson & W. Richard McCombie Affiliations.Coming of age: ten years of next-generation sequencing technologies[J].Nature Reviews Genetics .2016,17,333–351.


NextSeq 550AR

是安诺优达与美国Illumina公司合作开发的新一代桌面式高通量基因测序仪,采用最新研发的双通道“边合成边测序(SBS)”技术和经典的“可逆末端终止子”专利技术,具有通量高、速度快、数据精准、性能稳定、操作简单等诸多优势,与目前市面现有的设备比较,其数据质量、稳定性以及批量样本处理能力等均具有显著领先的优势。同时, NextSeq 550AR也具备极强的临床和学术应用延展性,包括PGS、液体活检、FFPE测序、遗传病检测等都可以在此测序平台上进行试剂盒的开发和注册。


网站地图 隐私说明 使用条款

Copyright2012 Annoroad.com 安诺优达基因科技(北京)有限公司 版权所有

All rights reserved Annoroad Gene Technology 京ICP备12029022号-1