【精彩回顾】第一届农业基因组学青年学术研讨会
2019.10.29

2019年10月26日,由青岛农业大学、安诺优达生命科学研究院主办、安诺优达基因科技(北京)有限公司承办的“第一届农业基因组学青年学术研讨会”在青岛农业大学顺利召开。会议有幸邀请到来自中国科学院微生物研究所、遗传与发育研究所、海洋研究所、中国中医科学院中药研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、北京市农林科学院、西北农林科技大学、云南师范大学、青岛农业大学等多家单位的专家莅临,吸引了众多农业基因组领域优秀青年学者参与,与会者们就如何推动基因组学在农业研究中的应用展开深入交流和探讨。

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下面小编就带大家回顾下本届会议的精彩内容:

本届会议由青岛农业大学党委副书记王庆军和安诺优达副总裁高玉池分别致开幕辞。王庆军书记回顾了青岛农业大学的发展历程并预祝本次会议圆满成功。高玉池副总裁表示在技术不断升级革新、成本不断下降的情况下,安诺优达将依托完备的测序平台和丰富的研发经验,不断提供更快速、更高质量、更具有特色的基因组学技术服务,立足生命科学研究和产业转化,持续为用户提供更优质的产品和服务。

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                                           安诺优达基因科技副总裁 高玉池                           青岛农业大学党委副书记 王庆军

本次会议上来自中科院微生物研究所的胡松年研究员介绍了过去十几年植物基因组学的发展历程,从技术、方法、研究方向等多个角度详细阐释了植物基因组学的发展现状、面临的挑战和未来趋势。基于植物基因组面临的一些研究挑战,如多倍化、高杂合、高重复序列、超大基因组等,胡松年研究员还介绍了其研究团队在几个植物物种中最新的研究工作,利用多平台、多技术方案解决复杂植物基因组组装问题。

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中科院微生物研究所 胡松年研究员

中科院遗传与发育所的梁承志研究员重点介绍了如何依靠三代单分子长片段测序、光学图谱、遗传图谱、Hi-C等技术进行高质量的参考基因组组装,并利用比较基因组方法对这些基因组的进化和某些功能基因进行分析。此外,梁承志研究员还重点介绍了其研究团队开发的一个利用三代测序长片段进行基因组复杂区域组装的新方法——HERA,该方法已在玉米、苦荞等多个物种中进行测试,与已发表版本进行对比,组装质量提升显著,特别是高度复杂的植物基因组。这些高质量的基因组将用于构建泛基因组,提供更加精细的从基因型到表型的关联,为分子设计育种奠定坚实的基础。

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中科院遗传与发育研究所  梁承志研究员

来自西北农林科技大学的宋卫宁教授重点介绍了其在小麦基因组学上的研究工作。小麦和大麦是极为重要的粮食作物,由于其基因组的庞大和复杂,基因组学研究需要极大规模的投入,以及各种不同技术的整合。它们属于人类最早驯化的植物,因此而奠定了人类文明的基础。采集、保存及研究小麦和大麦的野生祖先,无论在理论和实际上都具有重大意义,影响深远。

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西北农林科技大学 宋卫宁教授

中国中医科学院中药研究所的孙伟副研究员介绍了其团队在药用植物穿心莲基因组上的研究工作。中医药是宝贵的民族财富,孙伟老师团队利用基因组学技术解析了穿心莲基因组序列,并结合代谢组学、转录组学等技术手段研究穿心莲重要代谢物质穿心莲内酯合成通路。同时,孙伟老师还介绍了其在栀子花基因组学研究上的最新工作进展。

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中国中医科学院中药研究所 孙伟副研究员

来自中国中医科学院中药研究所的张玉军研究团队的冷梁博士以紫苏为研究对象,对中草药植物基因组起源进化和次生代谢产物多样性问题进行研究。通过结合基因组组装分析、重测序和其它表型分析数据解析了紫苏在种子大小、节间距、开花期调控等重要生物学性状上的最新研究进展。

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中国中医科学院中药研究所 冷梁博士

青岛农业大学的张忠华教授系统地分享了其近几年在葫芦科植物中所进行的比较基因组学研究成果。其研究团队主要通过对黄瓜、西瓜、甜瓜、冬瓜等不同的葫芦科植物的基因组信息进行比较分析,阐释不同的果实形态和风味多样性在基因组层面是如何演化的,以及后续是如何将这些演化信息应用到重要功能基因的解析中。同时,张忠华教授还介绍了其团队在葫芦科植物的驯化和育种选择方面的工作。

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青岛农业大学 张忠华教授

北京农林科学院的效曾研究员重点分享了其实验室在植物miRNA预测、注释和miRNA数据库等方面的研究。miRNA是一类重要的转录后调控因子,高通量的测序技术为发现和鉴定植物中的miRNA提供了有力的数据支持。杨效曾研究员团队通过对植物miRNA特点的系统研究,挖掘和解析高通量的小RNA数据,开发出能够准确、高效地鉴定和注释植物miRNA的miRDP系列工具,并构建了植物综合miRNA数据库——PmiREN(www.PmiREN.com),为植物miRNA相关研究提供了很大地便利。

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北京农林科学院 杨效曾研究员

安诺优达生物信息项目总监刘涛博士介绍了安诺优达在云平台和三代基因组组装方面的最新进展。重点介绍了安诺云在数据存储、交付和分析方面的高安全、高速度和高灵活度等技术优势,以及与阿里云合作开发的基于批量计算的WDL-Canu组装纠错流程,解决了传统Canu分析流程周期慢、资源消耗多的问题,将基因组组装周期大幅缩短。此外,刘涛博士还介绍了安诺优达开发的基于多组学大数据的整体解决方案。          

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安诺优达生物信息项目总监 刘涛博士

中国科学院海洋研究所张晓军研究员介绍了其研究团队在凡纳滨对虾上的研究工作。对虾基因组是世界上公认的高复杂基因组,阻碍了多个国际科研机构的研究步伐。张晓军研究员团队通过多种技术手段最终完成了凡纳滨对虾基因组测序和组装,获得了对虾基因组参考图谱。在对虾基因组上发现了大量的物种特异性基因和大量的串联重复基因,它们可能与对虾科的特异性进化有密切联系。运用多组学数据并结合比较基因组初步分析了对虾环境适应的蜕皮调控、视觉感受、神经传导等方面的分子机理。

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中国科学院海洋研究所 张晓军研究员

中国水产科学研究院黄海水产研究所邵长伟研究员简要介绍了表观遗传的发展历程以及表观遗传的生物学现象,进而以半滑舌鳎为例,详细介绍表观遗传在鱼类性别决定和分化中的作用机制。最后通过介绍表观水平的分子育种技术(如EWAS、epiQTL等),阐述表观遗传在鱼类分子育种中的应用潜力。

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中国水产科学研究院黄海水产研究所 邵长伟研究员

云南师范大学的祝光涛研究员利用基因组、转录组和代谢组等生物大数据对番茄育种历史进行解析,全面分析了番茄果实大小和风味品质变化的遗传学基础和选择驱动力,解析了番茄驯化和现代育种过程中番茄大小和果实代谢组的变化的遗传基础,为番茄的育种历史的解析和风味育种提供了重要的价值。同时,祝光涛研究员还介绍了其团队在马铃薯育种方面的最新研究工作。

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云南师范大学 祝光涛研究员

2019年“第一届农业基因组学青年学术研讨会”已圆满结束,感谢各位专家的精彩分享,感谢各位参会嘉宾。此次会议虽已结束,但科研探索的精神不止。安诺优达将持续为广大科研伙伴提供更优质更专业的测序服务,助力科学研究。


张忠华教授


张忠华,教授,博士生导师。入选中组部“万人计划”科技创新领军人才和青年拔尖人才,获 “中国青年科技奖”,第二完成人获2018年国家自然科学二等奖,第一完成人获2018年中国农业科学院青年科技创新奖。中国园艺学会分子育种分会秘书长、青年分会常务理事,Journal of Integrative Agriculture (JIA)Horticultural Plant Journal等期刊编委,中央国家机关青联委员,全国青联常委。在NatureScienceCell等期刊共发表SCI论文42篇,累计影响因子超过400,共被引用6000余次。主持国家重点研发计划课题1项,2013年获国家自然科学基金委“优秀青年”科学基金项目,主持国家自然科学基金面上项目3项,主持国家973和863计划子课题。


安诺优达生命科学研究院


2018年7月安诺优达生命科学研究院正式获批成立,研究院以利用生命科学技术推动科学研究及人类健康事业的发展为主线,以浙江安诺优达生物科技有限公司为依托,建设成国际知名的以基因组学、转录组学、表观组学等多组学为核心的研究中心、一流的测序中心和大型数据处理超级计算中心、三维基因组学研究中心和单细胞多组学研究中心,利用生命科学技术不断推动科学研究及人类健康事业的发展。


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