一位做小麦根尖研究的老师,同一批样本连续做了3次单细胞实验,全部失败。核悬液背景脏、杂质多、细胞捕获数及基因数异常。这是植物单细胞实验最常见的场景,不是实验平台(10x Genomics / DNBelab C-TaiM4)不够好,而是样本卡在了前处理这一步。改用安诺优达抽核新流程后,同一批样本顺利产出高质量单细胞数据。这样的案例,在我们的交付记录里并非个例。
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为什么“抽核”是植物单细胞研究的高效路径
植物单细胞研究的真正门槛,不在实验平台,而在如何把细胞核干净、完整地释放出来。
与动物细胞不同,植物细胞外部包裹着一层厚实的细胞壁(纤维素、果胶和木质素构成)。传统的“原生质体”制备路线(scRNA-seq)虽能去除细胞壁,但也有明显的短板:
01 酶解耗时2–5小时,期间会诱导应激基因表达,干扰细胞的真实转录谱;
02 不同物种、组织的细胞壁组成差异巨大,酶解条件需要逐一摸索,难以通用;
03 依赖新鲜样本,冻存与野外采集样本几乎无法处理。
因此,单细胞核转录组(snRNA-seq)成为植物领域主流——绕开细胞壁直接释放细胞核,用核内转录本进行测序。既避免酶解应激,又缩短样本处理时间,还能兼容冻存及难消化组织。
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抽核vs原生质体:抽核数据可信么?
抽核不仅是单细胞研究的主流路线,单细胞多组学(ATAC)同样依赖抽核。那么,抽核数据到底可不可信?
同一组织并行比较snRNA-seq与scRNA-seq的研究表明,两者结论高度一致:细胞聚类注释一致、关键marker高度吻合;核转录本虽缺少胞质信息,但无酶解诱导应激反应干扰,适用组织更广。

图1 snRNA-seq 与 scRNA-seq细胞类型与比例比较( Wang et al., Plant methods, 2026 )
snRNA-seq与scRNA-seq主要差异点

对植物而言,snRNA-seq的广谱性使其成为更普适的选择。
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抽核"难"题如何破?安诺优达植物单细胞抽核试剂盒实测
抽核虽普适性更广,却并非“放进去就能出来”。植物组织类型多样,得核率与除杂难度差异悬殊。安诺优达研发团队长期攻关,积累了大量组织处理经验,针对性重构抽核流程,实现核心技术突破,正式推出升级版植物单细胞核提取试剂盒。
该产品针对细胞壁厚、杂质多、核易碎三大难点,采用「多物种组织适配+温和裂解+密度梯度纯化+低损伤重悬」四模块设计,30分钟内稳定产出高纯度、高完整度的细胞核悬液,适配多种复杂样本,为单细胞测序提供可靠保障。
依托升级流程,安诺优达对合格样本做出明确数据承诺:DNBelab C-TaiM4(C4)平台捕获细胞数≥8,000,基因中位数≥800(黑名单样本除外)。抽核质检合格样本,不成功不收费。

图2 安诺优达植物单细胞核提取试剂盒
针对植物样本的四大核心挑战,新流程的解决思路如下:

在相同组织上,我们将安诺试剂盒与其他试剂盒做头对头对比,并在多种物种中复测验证:
比对结果一,相同样本量抽核,试剂盒新流程得核量充足,满足上机要求。

比对结果二,通过优化上层密梯组分及核悬液离心配比,核膜更完整,极少涨破。

比对结果三,通过优化密度梯度离心及除杂参数,显著降低杂质比例,减少上样堵孔风险,提升高质量细胞捕获数。

比对结果四,试剂盒新流程得核率较流式除杂提升约40%,且操作更简便、耗时更短。

我们在多种物种与组织中验证新方案,并重点复测了过往数据不佳的组织。

图7 其他试剂盒vs安诺试剂盒新流程数据结果比对

图8 安诺优达试剂盒新流程数据聚类结果
安诺优达试剂盒新流程在细胞捕获数、基因中位数、Fraction of reads in cell三个重要指标中,均有较大提升,聚类分群清晰,反映出核质量的根本性改善。意味着用相同或更少的组织量,获取更高质量的数据、更低的背景噪音、更优的测序成本效益,为高置信度的单细胞图谱构建和机制挖掘奠定了坚实的数据基础。
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安诺优达植物单细胞经验展示
目前安诺优达已成功交付几十种物种组织类型的单细胞数据,组织类型涵盖根、茎、叶、花瓣、果肉、愈伤组织等。

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选择安诺优达:从抽核到测序到数据分析,一站式交付
您只需提供样本,剩下的交给我们。
安诺优达植物单细胞服务流程透明可控,您可实时掌握实验进展: