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助力种质资源研究|安诺优达野生植物HiFi单cell产出突破45G!
2022-12-14 13:49

种质资源研究

近年种质资源研究越来越火热。过去,二代测序技术为种质资源开发立下汗马功劳,但由于二代测序序列短,在深入挖掘数据背后机制时不可避免会出现假阳性、连续性低、数据支持度不足等问题。


Pacific Biosciences公司研发的单分子实时测序系统(Single Molecule Real Time,SMRT)为开发种质资源提供一种新方法。基于SMRT测序技术,通过环状重复测序和序列自身校正,能够同时获取长读长、高精度、并带有甲基化信号的HiFi数据。自该技术推出以来,HiFi数据在分子育种、进化机制研究、等位基因差异分析、复杂性状关键基因定位研究中得到广泛应用。


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HiFi测序原理图


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HiFi数据出原理图


高产出才能高深度

挖掘种质资源时,除实验技术相对成熟的物种(常见作物、家畜等)外,还要面对一些含有高次生代谢产物、提取含有蛋白污染、提取得率低的物种,如:野生物种,孤儿作物等。


为了保障核酸完整性,测序前虽然会对核酸和文库进行纯化处理,但并不能完全消除杂质,所以上述物种的产量往往低于常规物种。

安诺优达通过自主研发,不断优化提取-建库-测序流程,不断尝试攻坚,最终突破技术壁垒,实现野生植物单Cell HiFi产出45G,单Cell的高产出有助于测序深度提升,获取更详实的基因信息。

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长读长才能高精度

要实现高精度HiFi产出,polymerase读长是关键,在相同的插入片段长度下(15 kb或者20 kb),polymerase越长,pass数(滚动多少圈)越多,得到的数据质量(QV)越高,通常mean pass>10,准确率达到QV30(99.9%)!


安诺优达不断优化测序体系,实现平均200 kb polymerase N50 读长,能够获取更高精度的HiFi产出,为定位关键SNP、InDel、SV提供有力支撑!

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丰富的产品体系助力科研

为了打通原始序列与科研成果界限,助力科学研究,安诺优达不断直面挑战,立足客户需求,开发HiFi序列更多应用可能,我们可以提供多种科服产品建库测序-生信分析服务。还等什么呢?快来联系我们的驻地销售吧~

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