ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)是利用高通量测序检测转座酶易接近的染色质的一门技术。ATAC-seq 只需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。在 ATAC-seq 技术中,利用转座酶Tn5特异性识别并结合到开放染色质区域的裸露DNA上,切割DNA的同时插入测序接头,通过扩增形成完整文库,上机测序、分析鉴定染色质开放区域。
产品优势
- 低细胞起始量重复性好,信噪比高、特异性强、实验简单,耗时短
- 研究染色质互作全景能同时揭示开放染色质的基因组位置、DNA结合蛋白和转录结合位点的相互作用
- 物种范围广满足动物、植物等样本的要求,具有很好的物种适应性
- 应用范围广适用于免疫机制、发育调控、抗逆胁迫等生物学研究
应用方向
- 绘制染色质开放性图谱,鉴定细胞/组织特异性调控元件和转录因子
- 表观修饰差异研究,从转录调控揭示生物变异的表观遗传基础
- 联合多组学,建立转录调控网络,打通基因组遗传变异与生物表型关联的“黑匣子”