lncRNA

产品简介
技术流程
样本要求
FAQ

长链非编码RNA（Long non-coding RNA, lncRNA）是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA，位于细胞核或胞质内。lncRNA起初被认为转录的“噪音”，而后越来越多的研究表明，lncRNA 在众多生命活动过程中发挥重要作用，lncRNA因此引起人们广泛的关注。lncRNA测序技术也随之广泛应用于基因表达调控、物种进化、物质代谢以及环境抗逆等研究。

产品优势

经验丰富
提取成功率85%+，建库成功率95%+，物种覆盖多，项目经验2,000+
实验技术成熟
采用官方建库试剂盒，rRNA残留率＜10%，且稳定
专业的实验/分析团队
实验/分析团队经验丰富，其中生信人员平均专注转录调控领域5年+
一站式服务
售前方案设计，售中异常解决，售后个性化分析，多方位服务

产品特点

可预测新的lncRNA
既可鉴定已知的lncRNA，又可以预测新的lncRNA
组学分析
lncRNA+mRNA、lncRNA+miRNA、全转录组、lncRNA+表观等
三位一体
三位一体的转录组分析解决方案（lncRNA-mRNA-circRNA）

应用领域

环境胁迫
转录调控
分子标记
生长发育等

产品类型	测序平台及策略	推荐数据量	数据质量
去核糖体链特异性文库	二代测序 PE150	≥12 G	Q30≥85%

产品类型	样品要求
lncRNA	样品需求量	动物样品：≥0.5 μg 植物叶片、茎类样品≥0.5 μg
	样品浓度	动物样品：≥60 ng/μl 植物叶片、茎类样品≥30 ng/μl
	样品纯度	OD260/280=1.8~2.2
	RNA完整性	植物样品RIN≥5.5 动物样品RIN≥5.8

Q：什么是长链非编码RNA？以及它们的作用？
A：
哺乳动物基因组序列中约5%～10%被稳定转录，蛋白质编码基因仅约占1%，其余4%～9%的序列都转录为非编码RNA。而非编码RNA（non-coding RNA）是指不能翻译为蛋白的功能性RNA分子。长链非编码RNA为这4%～9%中长度大于200 nt的非编码RNA。它们的作用主要体现在四个方面：第一，影响周边基因的表达；第二，调控蛋白质活动及定位；第三，产生小分子RNA；第四，对其他RNA的调控作用。
Q：rRNA的去除方法有哪些？
A：
有些long non-coding RNA有polyA尾，有些没有，为了保证能够获得所有long non-coding RNA，就不能用oligodT标记磁珠进行富集，只能用去rRNA试剂盒去除核糖体RNA。不同物种rRNA去除效果跟试剂盒中所使用探针的匹配程度有很大相关，如果去除效果不好，需要加大测序数据量达到相应的clean data。
Q：long non-coding RNA为什么构建链特异性文库？
A：
很多基因组区域具有正负链的转录本，反义转录是真核基因的一个特征，是一种重要的调控方式。使用ssRNA-Seq（Strand-Specific）能够保留RNA的方向性信息，可以确定转录本来自正链还是负链，以便更加准确的获得基因的结构以及基因表达信息。

lncRNA

单细胞&空间多组学

传统单细胞测序

空间转录组

高通量单细胞转录组

基因组&重测序

基因组

重测序

转录调控

转录组学

表观组学

微生物

宏基因组

微生物多样性测序